Se trata del "comando Donosti", "comando Madrid" y "comando Araba", aunque los investigadores policiales no se atreven a pronunciarse sobre la constitución de un "comando Andalucía" propiamente dicho, de acuerdo con fuentes de la lucha antiterrorista consultadas por Servimedia.

Los "comandos" que han demostrado más operatividad, tras el desmantelamiento del "Vizcaya", son el "Donosti" y el "Araba". Precisamente, la Policía no descarta que miembros de este último comando terrorista fueran los autores el reciente atentado frustrado con bomba-lapa contra el concejal del PP en la localidad alavesa de Santa Cruz de Campezo, Fernando Vinsa.

En cuanto al "comando Madrid", no ha realizado ninguna acción terrorista desde que la Policía localizara hace unos meses varios pisos franco en la capital de España, lo que hace pensar a los investigadores que no dispone de infraestructura adecuada en la actualidad para asentarse en Madrid.

Por lo que se refiere a los miembros de ETA reconocidos por la Policía,se señala la pertenencia al "comando Donosti" de etarras como Javier García Gaztelu y José Ramón Carasatorre. En el "comando Madrid", los expertos en la lucha contra ETA ubican al pistolero Jon Bienzobas, presunto asesino de Francisco Tomás y Valiente, y a José Antonio Olarra Guridi.

Respecto a la situación del "comando Araba", la policía no descarta que su operatividad haya quedado mermada tras la detención de uno de sus miembros, José Antonio Hernández Velasco, que actuaba entonces como "activista lgal" (no fichado por la policía) en una operación que tuvo lugar en el Alto de Urkiola, así como por el desmantelamiento por parte de la Ertzaintza de un piso que disponía el comando en Bergara (Guipúzcoa).

No obstante, en el "Araba" se mantienen identificados por la Policía los liberados Krispín Garcés y Aitor Bores, a quienes se les atribuye, entre otras acciones, el atentado contra el cuartel militar de Araka (Vitoria).

En cuanto a Andalucía, los expertos policiales en la lucha contra el terroismo prefieren no apresurarse en afirmar que existe como tal un "comando Andalucía", aunque sí reconocen que la banda ETA goza de una buena infraestructura de información y apoyo en la zona, como lo acredita la relación de atentados ocurridos en esta comunidad desde mediados de 1996 hasta ahora.