Con este acuerdo, las fundaciones colaborarán de forma estable bajo el marco de la Cátedra Atapuerca, que creó la entidad soriana en 1999 para coordinar las investigaciones en el yacimiento.

La Fundación Duques de Soria será la encargada de organizar las reuniones científicas sobre los descubrimients en el yacimiento y la Fundación Atapuerca tendrá a su cargo la gestión del programa integrado de becas de investigación.