La oficina desarrollará el denominado "Programa Mediterráneo", que tendrá dos grandes líneas de actuación: la conservación de la biodiversidad y el uso sostenible de los recursos naturales. Entre las áreas que se incluyen destacan la desertificación, la conservación del paisaje y la gestión sostenible e integrada de la zona costera.

El ámbito geográfico del programa incluirá todos los Estados e islas que lindan con el Mediterráneo, junto con Jordania, Portual y la ex república yugoslava de Macedonia, que se consideran cultural y ecológicamente mediterráneos.

La Unión Mundial para la Conservación de la Naturaleza (UICN) fue creada en 1948 y es la mayor organización internacional dedicada a la conservación de la naturaleza. Desde 1999, tiene el papel de observador ante las Naciones Unidas.

El Ministerio de Medio Ambiente destinará un presupuesto específico cada año para el funcionamiento de la oficina. Para el 2000, la aportación prevista es de 25 milones de pesetas.