El IMA, que estará gestionado y coordinado por el Vicerrectorado de Investigación de la UAH, realizará actividades de investigación que contribuyan a asegurar el aprovechamiento y gestión integral del agua e impartirá estudios de postgrado y doctorado en las diferentes áreas de conocimiento relacionadas con el agua.

Asimismo, ofrecerá servicios especializados de laboratorio, asesoría técnica, información y calidad en lo referente a gestión, conservación, tratamiento y reutilización del agua a los sectores públicos y privados de la región, así como a instituciones y organismos nacionales e internacionales.

También promoverá la educación y la cultura en torno al consumo sostenible y al cuidado de la calidad del agua, y pretende contribuir al desarrollo e implantación de aquellas tecnologías del agua que mejor se adapten a las condiciones ambientales, teniendo en cuenta el tratamiento y reutilización de aguas residuales, la calidad de los recursos hídricos, la conservación ambiental y los aspectos socioeconómicos de la gestión del agua.

Asimismo participarán en el IMA grupos de investigación de otras universidades, organismos públicos de investigación e importantes empresas del sector.