El certamen lo organiza la Fundación Biodiversidad del Ministerio, y busca promover la protección de la naturaleza en los municipios españoles a través de iniciativas de conservación.

La iniciativa se enmarca en el proyecto "Life +, capitales europeas de la biodiversidad", y cuenta con un presupuesto de 1,6 millones de euros, cofinanciado por la Comisión Europea en un 50%.

A través de este concurso se evaluarán las medidas que los ayuntamientos pongan en marcha para la correcta conservación de la diversidad biológica a través de sus respuestas en torno a cinco aspectos: espacios verdes, instrumentos de planificación, sensibilización, seguimiento y biodiversidad en la agricultura, los montes y las aguas continentales.

Para inscribirse, los ayuntamientos tendrán que hacerlo en una de las cuatro categorías existentes, y que diferencian entre los municipios con menos de 1.000 habitantes, los que tengan entre 1.001 y 5.000, entre 5.001 y 30.000 y los de más de 30.000 habitantes. Para cada una de ellas se seleccionarán tres ganadores, de entre los cuales sólo uno conseguirá el reconocimiento de "Capital de la biodiversidad".

El ayuntamiento ganador será invitado a participar en la Cumbre de Ciudades por la Biodiversidad que se celebrará durante la 10ª Conferencia de las Partes del Convenio sobre la Diversidad Biológica (COP10) en Nagoya (Japón), en octubre de este año.