El acuerdo incluye la promoción y realización conjunta de proyectos coordinados o concertados de investigación técnica y científica, la utilización conjunta de personal, instalaciones, equipos, documentación y bases de datos, la formaión y especialización de científicos y técnicos y la realización de proyectos de ayuda al desarrollo del sector salud en países o regiones seleccionadas.

El Instituto Carlos III ofrece como garantías de su política de cooperación el alto desarrollo científico-técnico de su personal e instalaciones y el hecho de ser una institución globalizadora que comprende la práctica totalidad de las áreas del conocimiento de la salud pública.