La limpieza del fondo del estanque es necesaria para que los participantes en este certaen puedan recorrer a nado los cerca de 400 metros de que consta la prueba.

La organización corre a cargo del Instituto Municipal de Deportes, la Federación Madrileña de Natación y la Federación Madrileña de Actividades Subacuáticas. El Ejército de Tierra también colabora con la instalación de una tienda con duchas de agua caliente y puestos de chocolate para los participantes.

La III Travesía Popular del Estanque del Retiro se realiza a favor de la Aldeas Infantiles, organización que se dedica alcuidado de niños huérfanos y desamparados.