Según recoge el convenio suscrito, su objetivo será preservar y mejorar los ecosistemas del Delta, evitar su regresión y garantizar su sostenibilidad.

El 4 de diciembre de 2001 se había suscrito un convenio de colaboración entre la Administración General del Estado y la Generalitat de Cataluña para la redacción del Plan Integral de Protección del Delta del Ebro, cumpliendo así con el mandato de la Disposición Adicional décima de la Ley del Plan Hidrológico Nacional. Ambas administraciones habían entendido que para la realización del objeto de dicho convenio era necesaria la creación de un consorcio.

Sin embargo, se produjeron novedades legislativas y esa alteración del marco normativo y funcional imposibilitó el cumplimiento de las obligaciones y finalidad asumidas en el convenio firmado aquel año.

En consecuencia, el consorcio como instrumento para la gestión y desarrollo del mismo perdió su razón de ser, y ambas administraciones han acordado dejarlo sin efecto y colaborar ahora en la elaboración de un Plan Integral que proteja y garantice la sotenibilidad de todos los sistemas que integran esta zona de gran valor ambiental.