La comisión está presidida por el ministro de Fomento, mientras el subsecretario de dicho departamento será el vicepresidente, según el decreto aprobado por el Gobierno el pasado 22 de noviembre.

Los vocales de la comsión serán los consejeros elegidos al efecto por las comunidades autónomas, así como un representante de los ministerios de Agricultura y Pesca y de Medio Ambiente, y el director general de Política Autonómica del Ministerio de Administraciones Públicas.