La contaminación del Segura es un problema que se remonta a varias décadas a causa de la sobreexplotación y la salinización, que se vieron agravadas por la sequía que sufrió la zona entre 1990 y 1995.

En la recuperación del río, la Comunidad Valenciana firmó convenios con la Diputación de Alicante mediante los cuales se han instalado depuradoras en municipios de menos de 2.000 habitantes.